Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms