Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms