Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BSDC1Q9NW68 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSDC1Q9NW68 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms