Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLE1Q9NVX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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