Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4F12Q9HCS2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms