Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MIXL1Q9H2W2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MIXL1Q9H2W2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms