Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms