Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms