Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms