Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHCHD5Q9BSY4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHCHD5Q9BSY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms