Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms