Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms