Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms