Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms