Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGF29Q96ES7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms