Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNERQ8NFT8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms