Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms