Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms