Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms