Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL35Q6PF15 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms