Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA2Q15822 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms