Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MRI1-205ENST00000591688 897 ntTSL 216.89■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 HAAO-207ENST00000431905 827 ntTSL 315.43■□□□□ 0.065e-18■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TMEM129-203ENST00000460722 1100 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 COL27A1-206ENST00000490831 666 ntTSL 314.41□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 HAAO-204ENST00000404451 651 ntTSL 314.32□□□□□ -0.125e-18■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF1-204ENST00000414781 957 ntTSL 513.01□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 HIP1R-203ENST00000535012 924 ntTSL 311.77□□□□□ -0.532e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 COPG1-203ENST00000504547 586 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TPCN1-205ENST00000546503 389 ntTSL 35.29□□□□□ -1.562e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-204ENST00000587022 298 ntTSL 38.9□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.257e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.267e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 56.2□□□□□ -1.427e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 NF1-216ENST00000495910 8223 ntTSL 25.58□□□□□ -1.527e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.44□□□□□ -1.547e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.192e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 219.07■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-213ENST00000487165 2020 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-207ENST00000462843 810 ntTSL 315.64■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-219ENST00000634471 748 ntTSL 315.64■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-216ENST00000495655 2700 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 PKDCC-209ENST00000492861 693 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 BRF1-214ENST00000549044 521 ntTSL 417.9■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.148e-10■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 NT5C1B-RDH14-201ENST00000444297 1695 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 NT5C1B-RDH14-202ENST00000532967 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 RDH14-202ENST00000468071 737 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 TMEM201-203ENST00000416541 3447 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.578e-10■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 NDOR1-205ENST00000612145 564 ntTSL 422.42■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 213.55□□□□□ -0.248e-9■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.089e-11■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.029e-11■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 224.91■■□□□ 1.582e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 TRAF7-204ENST00000567645 737 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 AKR1A1-205ENST00000473038 948 ntTSL 214.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 AKR1A1-213ENST00000497973 667 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 AKR1A1-211ENST00000495913 421 ntTSL 39.58□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 NCOR2-220ENST00000493859 557 ntTSL 312.46□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 NCOR2-222ENST00000536195 452 ntTSL 311.37□□□□□ -0.599e-8■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 FBRS-209ENST00000570170 1316 ntTSL 513.45□□□□□ -0.268e-9■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 TRAF4-209ENST00000473421 585 ntTSL 311.55□□□□□ -0.566e-12■■■■■ 40.5
EFTUD2Q15029 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.839e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 PGS1-211ENST00000589425 1944 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 PGS1-209ENST00000588169 1700 ntTSL 219.61■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 PGS1-212ENST00000589426 2033 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 PGS1-202ENST00000585521 721 ntTSL 515.53■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 STARD3-205ENST00000471896 2129 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 NAPRT-211ENST00000498076 448 ntTSL 214.83□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 HNRNPU-225ENST00000640119 461 ntTSL 511.21□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 STARD3-226ENST00000583884 602 ntTSL 310.22□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.783e-11■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 VARS2-206ENST00000473916 2000 ntTSL 218.56■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 40.4
EFTUD2Q15029 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.271e-10■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 216.25■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 315.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 311.81□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 48.15□□□□□ -1.15e-13■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 CDC20-203ENST00000478882 755 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 XAB2-202ENST00000595288 4555 ntTSL 216.03■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 ZNF445-203ENST00000460529 1312 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.254e-12■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 IDI1-203ENST00000429642 1017 ntTSL 521.83■■□□□ 1.094e-12■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.764e-12■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 IDI1-204ENST00000482091 1029 ntTSL 512.4□□□□□ -0.424e-12■■■■■ 40.3
EFTUD2Q15029 BTF3-205ENST00000509708 515 ntTSL 53.57□□□□□ -1.841e-6■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 IPO4-205ENST00000558233 1015 ntTSL 515.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 E2F4-210ENST00000568485 707 ntTSL 220.44■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 E2F4-203ENST00000563238 736 ntTSL 210.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 TNPO2-209ENST00000588151 546 ntTSL 316.4■□□□□ 0.229e-11■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 40.2
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