Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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