Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
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