Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms