Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 BBS4-203ENST00000561914 777 ntTSL 56.83□□□□□ -1.326e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-217ENST00000569338 843 ntTSL 54.16□□□□□ -1.746e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-208ENST00000565160 681 ntTSL 33.92□□□□□ -1.786e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 414.52□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 213.46□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ATXN2-217ENST00000548492 556 ntTSL 45.3□□□□□ -1.569e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 AC006001.3-202ENST00000639011 1819 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.837e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RUNDC1-202ENST00000589705 959 ntTSL 525.96■■□□□ 1.757e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.727e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)25.58■■□□□ 1.697e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.57e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.467e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 524.15■■□□□ 1.461e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.47e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CATSPERE-205ENST00000460986 725 ntTSL 323.58■■□□□ 1.377e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CHAF1A-205ENST00000587580 494 ntTSL 323.34■■□□□ 1.337e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 523.07■■□□□ 1.287e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-214ENST00000560736 897 ntTSL 322.63■■□□□ 1.217e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)22.59■■□□□ 1.217e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 UHRF2-209ENST00000481049 635 ntTSL 521.99■■□□□ 1.117e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.117e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-209ENST00000596953 1043 ntTSL 221.94■■□□□ 1.17e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-202ENST00000593637 1043 ntTSL 321.94■■□□□ 1.17e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RNF170-201ENST00000240159 2023 ntTSL 221.77■■□□□ 1.077e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-209ENST00000490837 557 ntTSL 421.63■■□□□ 1.057e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-218ENST00000602028 770 ntTSL 521.33■■□□□ 1.017e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-209ENST00000597666 604 ntTSL 321.33■■□□□ 1.017e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.997e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.977e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-216ENST00000601358 1481 ntTSL 1 (best)21.07■□□□□ 0.967e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.967e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.967e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.957e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.957e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.917e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)20.76■□□□□ 0.917e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.891e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TOP3A-204ENST00000472959 913 ntTSL 320.56■□□□□ 0.887e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.871e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.877e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CHAF1A-203ENST00000585854 499 ntTSL 220.38■□□□□ 0.857e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 KIAA1551-205ENST00000535606 391 ntTSL 320.37■□□□□ 0.857e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.837e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.87e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 520.05■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZNF395-203ENST00000517459 224 ntTSL 219.99■□□□□ 0.797e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 319.89■□□□□ 0.777e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 519.57■□□□□ 0.721e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.727e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.717e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.77e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.77e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CATSPERE-208ENST00000478554 584 ntTSL 319.36■□□□□ 0.697e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 419.23■□□□□ 0.677e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.647e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 TIMM50-217ENST00000601403 769 ntTSL 518.91■□□□□ 0.627e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.617e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NUBPL-208ENST00000550649 557 ntTSL 518.75■□□□□ 0.597e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZNF395-207ENST00000521185 584 ntTSL 418.63■□□□□ 0.577e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 218.45■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-215ENST00000561050 1856 ntTSL 218.45■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.527e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 218.1■□□□□ 0.497e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 DPH7-210ENST00000479650 1797 ntTSL 518.07■□□□□ 0.487e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ANO6-206ENST00000550630 835 ntTSL 317.95■□□□□ 0.467e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 517.9■□□□□ 0.467e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZNF395-205ENST00000520290 703 ntTSL 517.44■□□□□ 0.387e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.387e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A11-208ENST00000579988 910 ntTSL 317.37■□□□□ 0.377e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.367e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.367e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-213ENST00000520472 912 ntTSL 517.23■□□□□ 0.357e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 217.19■□□□□ 0.347e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-203ENST00000594583 680 ntTSL 317.12■□□□□ 0.337e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.327e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-206ENST00000558674 2189 ntTSL 216.96■□□□□ 0.317e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.37e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.287e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-211ENST00000559837 756 ntTSL 316.81■□□□□ 0.287e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TSPAN9-204ENST00000444315 570 ntTSL 416.73■□□□□ 0.277e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 516.69■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-210ENST00000597782 456 ntTSL 516.67■□□□□ 0.267e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 416.58■□□□□ 0.241e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 516.5■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 DPH7-207ENST00000475100 919 ntTSL 316.49■□□□□ 0.237e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.227e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-210ENST00000597607 1164 ntTSL 316.45■□□□□ 0.227e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-221ENST00000522458 623 ntTSL 416.33■□□□□ 0.27e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.197e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-214ENST00000583038 4930 ntTSL 216.21■□□□□ 0.187e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 516.04■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RBM6-220ENST00000493652 581 ntTSL 215.97■□□□□ 0.157e-6■■■■□ 19.9
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