Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms