Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms