Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms