Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCS1P62166 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCS1P62166 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCS1P62166 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms