Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAG2P55895 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAG2P55895 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAG2P55895 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAG2P55895 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms