Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMP1P54849 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMP1P54849 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMP1P54849 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms