Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms