Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA5P31644 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA5P31644 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms