Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG12O94817 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG12O94817 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG12O94817 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms