Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATCO43716 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATCO43716 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms