Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC9O14530 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms