Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HACD1B0YJ81 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HACD1B0YJ81 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms