Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MVJ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MVJ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
A8MVJ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MVJ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms