Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms