Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms