Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms