Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 EPCAM-203ENST00000419334 609 ntTSL 318.85■□□□□ 0.612e-20■■■■■ 226.7
UTP3Q9NQZ2 EPCAM-205ENST00000474691 714 ntTSL 514.64□□□□□ -0.072e-20■■■■■ 226.7
UTP3Q9NQZ2 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 226.7
UTP3Q9NQZ2 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 226.7
UTP3Q9NQZ2 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 226.7
UTP3Q9NQZ2 EPCAM-206ENST00000490733 752 ntTSL 35.68□□□□□ -1.52e-20■■■■■ 226.7
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-203ENST00000577376 720 ntTSL 227.21■■□□□ 1.952e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.732e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.292e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-206ENST00000579381 462 ntTSL 522.87■■□□□ 1.252e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.252e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-207ENST00000581229 598 ntTSL 421.56■■□□□ 1.042e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-212ENST00000583307 886 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-204ENST00000577513 731 ntTSL 310.01□□□□□ -0.812e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-214ENST00000583953 564 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 226.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF100-205ENST00000598026 588 ntTSL 414.55□□□□□ -0.088e-9■■■■■ 226.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.468e-9■■■■■ 226.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.788e-9■■■■■ 226.4
UTP3Q9NQZ2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 226.1
UTP3Q9NQZ2 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 226.1
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.055e-7■■■■■ 225.8
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.925e-7■■■■■ 225.8
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 225.8
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 225.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-216ENST00000524367 962 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 225.6
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-206ENST00000540314 578 ntTSL 418.62■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 225.6
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-205ENST00000536826 570 ntTSL 418.07■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 225.6
UTP3Q9NQZ2 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 26.51□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 225.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.2□□□□□ -2.382e-7■■■■■ 225.5
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-204ENST00000379037 492 ntTSL 318.01■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 225.5
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.055e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.465e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 CLK3-205ENST00000561673 639 ntTSL 310.94□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 CLK3-212ENST00000563418 10498 ntTSL 37.17□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 225.4
UTP3Q9NQZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.452e-8■■■■■ 225.2
UTP3Q9NQZ2 IFT140-204ENST00000439987 2580 ntTSL 216.12■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 225.2
UTP3Q9NQZ2 FAM228B-204ENST00000486967 581 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 225.2
UTP3Q9NQZ2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.581e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.161e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-244ENST00000640174 1125 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-251ENST00000640870 1687 ntTSL 514.34□□□□□ -0.111e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-247ENST00000640679 1816 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-229ENST00000638698 1302 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-211ENST00000579340 1168 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-209ENST00000578801 1264 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.621e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-225ENST00000638193 1342 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-226ENST00000638276 1865 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-237ENST00000639521 952 ntTSL 59.69□□□□□ -0.861e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-227ENST00000638309 1383 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.861e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-250ENST00000640827 1596 ntTSL 59.57□□□□□ -0.881e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-234ENST00000639135 914 ntTSL 59.18□□□□□ -0.941e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.941e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.181e-17■■■■■ 225.1
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-220ENST00000532517 5242 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 225
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-222ENST00000534140 3128 ntTSL 217.04■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 225
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-213ENST00000527898 2921 ntTSL 216.7■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 225
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-225ENST00000614369 3442 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 225
UTP3Q9NQZ2 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 MYO15B-228ENST00000584516 5709 ntTSL 1 (best)24.88■■□□□ 1.577e-10■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 MYO15B-234ENST00000619501 7167 ntTSL 523.15■■□□□ 1.37e-10■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.297e-10■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 MYO15B-235ENST00000621743 8646 ntTSL 522.77■■□□□ 1.247e-10■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 MYO15B-226ENST00000583560 769 ntTSL 516.92■□□□□ 0.37e-10■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 224.8
UTP3Q9NQZ2 HERC2-212ENST00000569772 598 ntTSL 512.73□□□□□ -0.378e-20■■■■■ 224.7
UTP3Q9NQZ2 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 224.5
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-204ENST00000558196 540 ntTSL 38.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 224.5
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)27.19■■□□□ 1.946e-7■■■■■ 224.2
UTP3Q9NQZ2 BRAT1-204ENST00000469750 5226 ntTSL 218.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 224.2
UTP3Q9NQZ2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-13■■■■■ 224.2
UTP3Q9NQZ2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 224.2
UTP3Q9NQZ2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.051e-13■■■■■ 224.2
UTP3Q9NQZ2 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.661e-13■■■■■ 224.2
UTP3Q9NQZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.641e-6■■■■■ 224.1
UTP3Q9NQZ2 MICAL3-205ENST00000424046 542 ntTSL 417.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 224.1
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-209ENST00000538034 453 ntTSL 516.91■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 224
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-206ENST00000535357 597 ntTSL 310.5□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 224
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