Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M3

DEFB129, Beta-defensin 129, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB129Q9H1M3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEFB129Q9H1M3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB129Q9H1M3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms