Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA1CQ9BQE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms