Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms