Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms