Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLUHP3Q96NS8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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