Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms