Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms